Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RDH8Q9NYR8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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