Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC10Q9NYD6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXC10Q9NYD6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms