Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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