Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms