Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB6BQ9NRW1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms