Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MMP26Q9NRE1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms