Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DUOX1Q9NRD9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DUOX1Q9NRD9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms