Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms