Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GLB2Q9NR46 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms