Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASS4Q9NQ75 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms