Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FANCFQ9NPI8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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