Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAT1LQ9HCJ6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAT1LQ9HCJ6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms