Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKRIP1Q9H875 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKRIP1Q9H875 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms