Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NRDE2Q9H7Z3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms