Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCL3Q9H2J4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms