Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFDQ9GZP0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDGFDQ9GZP0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms