Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms