Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ROPN1BQ9BZX4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms