Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRNKL1Q9BZJ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRNKL1Q9BZJ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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