Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms