Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YTHDF1Q9BYJ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms