Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FANCD2Q9BXW9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FANCD2Q9BXW9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms