Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
HIRIP3Q9BW71 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HIRIP3Q9BW71 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms