Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GINS3Q9BRX5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms