Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COPS8Q99627 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS8Q99627 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms