Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL13Q99616 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms