Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EYA3Q99504 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms