Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRBNQ96SW2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRBNQ96SW2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms