Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSRNP1Q96S65 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRNP1Q96S65 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms