Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX18Q96RF0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms