Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB3IPQ96QF0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB3IPQ96QF0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms