Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC7Q96NW7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms