Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms