Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HIC2Q96JB3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms