Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCANQ96GW7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BCANQ96GW7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms