Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC97Q96F63 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC97Q96F63 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms