Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCTD12Q96CX2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCTD12Q96CX2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms