Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RNF34Q969K3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms