Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAD50Q92878 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAD50Q92878 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms