Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PHF3Q92576 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms