Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TOPBP1Q92547 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TOPBP1Q92547 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms