Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC4Q8WW27 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC4Q8WW27 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms