Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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