Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC148Q8NFR7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC148Q8NFR7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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