Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC21AQ8NDW8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms