Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMNTD2Q8IXW0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms