Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLF2Q8IX21 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLF2Q8IX21 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms