Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC84Q86UT8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC84Q86UT8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms