Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms