Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms